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學術動態(tài)

植物保護學院金豐良/龐銳團隊發(fā)布昆蟲細胞色素P450數(shù)據(jù)庫助力昆蟲解毒代謝研究

來源單位及審核人:植物保護學院 陳建平 編輯:藍學明審核發(fā)布:費思迎發(fā)布時間:2025-01-17

  近日,,植物保護學院/綠色農(nóng)藥全國重點實驗室金豐良/龐銳團隊在國際知名學術期刊“Molecular Ecology Resources(中科院一區(qū)Top,,IF5year = 7.8)上在線發(fā)表了題為“Insect Cytochrome P450 Database: An Integrated Resource of Genetic Diversity, Evolution and Function”的研究論文,。該研究通過廣泛收集和分析昆蟲基因數(shù)據(jù),,構建了目前昆蟲學領域最為廣泛,、全面且標準化的綜合昆蟲解毒代謝核心基因細胞色素P450信息平臺,。這為昆蟲抗藥性的形成與適應性進化研究提供了重要資源,。

  昆蟲是地球上數(shù)量最多,、種類最豐富的動物群體,對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和糧食安全產(chǎn)生直接影響,。細胞色素P450在昆蟲體內(nèi)負責代謝植物化感物質(zhì),、殺蟲劑和環(huán)境污染物,并在昆蟲抗藥性的形成以及昆蟲與植物之間的相互作用中發(fā)揮著至關重要的作用,。該基因家族在植物保護與害蟲防治中也具有重要意義,。

  隨著測序技術的發(fā)展和成本的降低,越來越多的昆蟲完成了全基因組測序,,發(fā)現(xiàn)了大量的P450基因,。然而,這些P450基因的數(shù)據(jù)缺乏統(tǒng)一的格式標準以及深度的信息挖掘,。本研究從682種昆蟲的高質(zhì)量基因組中識別出P450基因家族,。通過對這些重新識別的P450基因進行注釋、系統(tǒng)發(fā)育分析和結構解析,,研究團隊構建了昆蟲細胞色素P450數(shù)據(jù)庫(ICPD),,提供關于昆蟲P450多樣性和結構特征的綜合數(shù)據(jù)。此外,,ICPD支持蛋白質(zhì)結構的交互式可視化,,以及分子對接、突變蛋白結構預測和蛋白質(zhì)結構相似性計算等服務,。

  該數(shù)據(jù)庫旨在為學術界及相關領域的用戶提供以下兩方面的支持:(1)一個關于昆蟲P450基因家族的免費且用戶友好的資源庫,;(2)一個允許用戶比較多個P450蛋白結構的工具,并能夠使用任意化學分子構建配體對接,。這些資源和工具將大大促進對昆蟲P450基因多樣性和進化的研究,,同時有助于P450酶的挖掘與功能分析,對未來新殺蟲劑的設計具有重要價值,。

  我校植物保護學院/綠色農(nóng)藥全國重點實驗室是該論文的第一完成單位,,學院博士生吳洪鑫與中山大學生命科學學院的碩士生李鐘晟為論文的共同第一作者。龐銳副研究員和金豐良研究員是該論文的共同通訊作者,。參與本研究的還有植物保護學院許小霞教授,、碩士生鐘梓春、郭玉靜,、何柳燕,,以及數(shù)學與信息學院、軟件學院的毛宜軍老師和唐德玉教授,。此外,,中山大學生命科學學院的張文慶教授也參與了研究。本研究得到了國家重點研發(fā)計劃經(jīng)費和數(shù)據(jù)空間技術與系統(tǒng)全國重點實驗室開放基金的資助。


  相關論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.14070

  數(shù)據(jù)庫鏈接:http://www.insectp450.net


文圖/植物保護學院 許小霞

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