近日，豬禽種業(yè)全國重點實驗室、國家生豬種業(yè)工程技術(shù)研究中心、廣東省農(nóng)業(yè)動物基因組學(xué)與分子育種重點實驗室，我校動物科學(xué)學(xué)院李加琪/張哲教授團隊聯(lián)合國內(nèi)外多家合作單位，成功構(gòu)建了豬大規(guī)模復(fù)雜性狀遺傳解析數(shù)據(jù)庫PigBiobank (http://pigbiobank.farmgtex.org/)，并于2023年11月13日在國際權(quán)威期刊Nucleic Acids Research（IF=14.9）發(fā)表了題為“PigBiobank: a valuable resource for understanding genetic and biological mechanisms of diverse complex traits in pigs”的研究論文（論文鏈接：https://doi.org/10.1093/nar/gkad1080)。

　　精準解析豬復(fù)雜性狀對了解動物復(fù)雜性狀遺傳調(diào)控機制和提高豬群生產(chǎn)性能意義重大。然而，當前以豬復(fù)雜性狀為核心的綜合性數(shù)據(jù)庫匱乏，極大地限制了不同領(lǐng)域科學(xué)家對豬復(fù)雜性狀遺傳機制的深入探索。為幫助更多領(lǐng)域科學(xué)家精準解析豬復(fù)雜性狀，作為FarmGTEx國際畜禽動物研究計劃PigGTEx聯(lián)盟的系列工作之一， PigBiobank收集了來自全球71, 885頭豬的264個復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）結(jié)果、PigGTEx項目產(chǎn)生的豬34個組織5類分子數(shù)量基因座（molQTLs）結(jié)果、Ensembl等多種來源的豬多組學(xué)數(shù)據(jù)以及UKB等跨物種復(fù)雜性狀數(shù)據(jù)，并對這些大數(shù)據(jù)資源進行統(tǒng)一的整合分析和可視化，進而形成了以豬復(fù)雜性狀為核心的綜合性數(shù)據(jù)庫 PigBiobank (http://pigbiobank.farmgtex.org/)。

　　當前版本的PigBiobank數(shù)據(jù)庫中涵蓋了豬復(fù)雜性狀相關(guān)的豐富的數(shù)據(jù)，包括：豬264項全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）的1371288個顯著位點、豬34個組織5種分子表型的161680個全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析（TWAS）顯著位點、40978個孟德爾隨機化（MR）顯著關(guān)聯(lián)結(jié)果、30347個共定位分析（COLOC）顯著關(guān)聯(lián)結(jié)果，以及復(fù)雜性狀顯著位點的富集分析和基于統(tǒng)計量的遺傳參數(shù)等。PigBiobank網(wǎng)站提供了包括性狀、基因、基因組變異和基因組區(qū)域在內(nèi)的4類查詢?nèi)肟诤陀脩粲押玫牟樵兘缑妫瑫r還提供PheWAS、Cross-Species comparison等在線分析工具。作為豬遺傳育種領(lǐng)域重要的公共資源和PigGTEx聯(lián)盟的重要工作之一，PigBiobank將得到持續(xù)的更新，為全球研究者持續(xù)提供豬復(fù)雜性狀相關(guān)的大數(shù)據(jù)支撐。

　　動物科學(xué)學(xué)院博士生曾浩南、博士生張文勁、博士生林清及高亞輝副教授為論文第一作者。動物科學(xué)學(xué)院張哲教授、奧胡斯大學(xué)房靈昭助理教授、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)丁向東教授為論文的通訊作者，我校動物科學(xué)學(xué)院李加琪教授參與了項目指導(dǎo)。此外，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所、中山大學(xué)、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)、廣西大學(xué)等國內(nèi)外15家研究機構(gòu)參與了該研究。該研究得到國家自然科學(xué)基金（32022078）、國家重點研發(fā)計劃項目（2022YFF1000900）、廣東特支計劃畜禽種業(yè)本土創(chuàng)新團隊項目（2019BT02N630）和國家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系（CARS-35）等項目的資助。

文圖/動物科學(xué)學(xué)院