9月22日，亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室、園藝學院夏瑞團隊在《Molecular Plant》（IF=27.5)在線發(fā)表了題為《TBtools-II: A One for All, All for One Bioinformatics Platform for Biological Big-data Mining》的研究論文，系統(tǒng)介紹和描述TBtools的新版本，即TBtools-II。TBtools-II在TBtools-I的基礎上優(yōu)化并新增了100+個功能，開發(fā)了插件（Plugin）模式并架設了插件倉庫（Plugin Store）。基于此，解決了軟件功能全面性與靈活性的主要沖突。（論文鏈接：https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(23)00281-2）

　　為輔助更多植物科學家處理生物大數(shù)據(jù)，TBtools-I應運而生，并于2020年08月發(fā)表于《Molecular Plant》期刊（Chen et al., 2020），截止目前引用＞5000次。過去三年，隨著植物生物信息領域的發(fā)展和個性化需求的增加，軟件用戶群個體持續(xù)增長，TBtools-Ⅰ已用的功能和模式無法良好應對。因此，TBtools-II 提出“我為人人，人人為我”的開發(fā)新理念，插件商店（Plugin Store）也應運而生；突破團隊的課題限制，通過提供簡便的插件開發(fā)接口，使用戶可以直接依據(jù)自己的需求，靈活的開發(fā)使用插件并分享，成為TBtools-Ⅱ的創(chuàng)作者之一。當前，TBtools 插件商店中已有94個插件，超過半數(shù)為TBtools用戶開發(fā)，功能覆蓋了生物文本處理和數(shù)據(jù)可視化等。

　　亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室、園藝學院夏瑞教授和陳程杰講師為論文的通訊作者，陳程杰講師為論文第一作者；TBtools項目組（吳亞、曾灶海、徐婧、劉元龍副教授、何業(yè)華教授），暨南大學李嘉威博士，河南大學王驍博士，中國熱帶科學院生物所馮筠庭博士以及湖南農(nóng)業(yè)大學陳浩博士參與了軟件優(yōu)化建議、開發(fā)測試等工作。論文工作得到廣東省重點研發(fā)、國家自然科學基金、國家重點研發(fā)等項目支持。

文圖/亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室