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學(xué)術(shù)動(dòng)態(tài)

林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院樹(shù)木學(xué)研究組報(bào)道山刺番荔枝的高質(zhì)量基因組

來(lái)源單位及審核人:林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院 陳曉梅 編輯:李彥華審核發(fā)布:陳芃辰發(fā)布時(shí)間:2023-09-14

植物基因組數(shù)據(jù)快速積累為植物分類(lèi)和系統(tǒng)演化提供了越來(lái)越多的生物信息性狀。近日,林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院唐光大副教授與福建農(nóng)林大學(xué)劉仲健教授團(tuán)隊(duì)合作在Ornamental Plant Research 雜志發(fā)表了題為“The Annona montana genome reveals the development and flavor formation in mountain soursop fruit”的研究論文 (鏈接:https://doi.org/10.48130/OPR-2023-0014),完成了山刺番荔枝的全基因組測(cè)序。通過(guò)比較基因組學(xué)分析表明木蘭科植物是真雙子葉植物的姐妹,而基于串聯(lián)法(ASTRAL)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)與并聯(lián)法的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)木蘭科系統(tǒng)發(fā)育位置不一致,這可能是由不完全譜系分類(lèi)(Incomplete Lineage Sorting, ILS)引起。全基因組復(fù)制(Whole genome Duplication, WGD)分析表明,山刺番荔枝和鵝掌楸的共同祖先經(jīng)歷了一次WGD事件,而這次WGD事件發(fā)生在木蘭目和樟目分化之后。

山刺番荔枝花和果實(shí)圖

番荔枝基因組系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化

唐光大副教授和福建農(nóng)林大學(xué)博士研究生陳桂珍為該文的共同第一作者,我校客座教授、福建農(nóng)林大學(xué)劉仲健教授為通訊作者。福建農(nóng)林大學(xué)蘭科植物保護(hù)與利用國(guó)家林草局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室蘭思仁教授、彭東輝教授、鄒雙全教授,博士研究生章迪楊、黃捷和劉定坤、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)王潔雨博士參與該項(xiàng)研究。該研究得到廣東省林業(yè)局項(xiàng)目、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目(No. 31870199)和福建農(nóng)林大學(xué)高峰學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目(72202200205)的資助。

另外,林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院樹(shù)木學(xué)研究組長(zhǎng)期致力于中國(guó)南方重要森林植物類(lèi)群的分類(lèi)與系統(tǒng)演化研究,已退休李秉滔教授是番荔枝科、大戟科、夾竹桃科、馬錢(qián)科等類(lèi)群的分類(lèi)學(xué)權(quán)威,主編和參編了大量專(zhuān)著,其中參與編寫(xiě)的《廣西植物志》第三至六卷獲得了2022年度廣西自然科學(xué)一等獎(jiǎng);姚綱老師對(duì)廣義大戟科葉下珠分支開(kāi)展了深入研究,發(fā)表了系列分類(lèi)修訂文章。近年來(lái),研究組總共發(fā)表了植物新種18種,修訂植物名稱(chēng)5種;主持編寫(xiě)“廣東省森林質(zhì)量精準(zhǔn)提升主要樹(shù)種造林技術(shù)”等文本,為深入推進(jìn)“綠美廣東”重要決策部署提供技術(shù)支撐。

姚綱老師在貴州興義發(fā)現(xiàn)的葉下珠屬新種——馬嶺河葉下珠Glochidion malingheense

唐光大老師在廣東南嶺石灰?guī)r溶洞發(fā)現(xiàn)的過(guò)路黃屬新種——大橋過(guò)路黃Lysimachia daqiaoensis


文圖/林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院

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