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學校要聞

我校在《自然—遺傳學》發(fā)表論文:破譯荔枝基因密碼 揭開起源馴化面紗

來源單位及審核人:宣傳部 楊志群 編輯:審核發(fā)布:宣傳部 陳芃辰發(fā)布時間:2022-01-04

論文截圖

  北京時間2022年1月4日,由我校亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室牽頭,聯(lián)合相關(guān)單位完成的論文《高雜合荔枝基因組中兩個不同單倍型表明早晚熟栽培品種各自獨立馴化》(Two divergent haplotypes from a highly heterozygous lychee genome suggest independent domestication events for early and late-maturing cultivars)發(fā)表在《自然—遺傳學》(Nature Genetics),。通訊作者包括我校園藝學院李建國研究員,、夏瑞教授和陳厚彬研究員,美國伊利諾伊大學香檳分校Ray Ming教授,,紐約州立大學布法羅分校Victor Albert博士,。第一作者為我校胡桂兵教授、馮筠庭博士生,、劉成明教授,、吳振先教授,廣東省農(nóng)業(yè)科學院向旭研究員,,新加坡南洋理工大學Jarkko Saloj?rvi博士和中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院王家保研究員,。

  荔枝基因密碼的破譯將為未來荔枝功能基因組研究提供重要的參考,對促進荔枝品種改良和產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要意義,。1月4日上午,,我校在紅滿堂召開相關(guān)成果發(fā)布會,。副校長仇榮亮主持發(fā)布會。

成果發(fā)布會現(xiàn)場

劉雅紅校長致辭

  校長劉雅紅在致辭中介紹了我?!笆濉逼陂g的科研進展和果樹學科的發(fā)展情況,。她指出,我校荔枝科研團隊以重大研究成果為支撐,,以區(qū)域特色品種為主導,,以打造具有華農(nóng)特色的品牌為核心,以現(xiàn)代企業(yè)管理為標準,,促進產(chǎn)前,、產(chǎn)中、產(chǎn)后緊密結(jié)合,,積極探索產(chǎn)學研相結(jié)合的創(chuàng)新工作模式,。她希望團隊繼續(xù)拓展研究的廣度和深度,為荔枝產(chǎn)業(yè)現(xiàn)代化插上科技的翅膀,,為擦亮廣東荔枝“金字招牌”,、實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)興旺和鄉(xiāng)村振興作出更大的貢獻。

劉耀光院士講話

  “基因組是植物性狀形成的設(shè)計圖和導航圖,,荔枝的基礎(chǔ)和應用研究一直是亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室的重要研究方向之一,。”國家重點實驗室主任劉耀光院士表示,,解碼荔枝基因組不僅能提升對荔枝重要經(jīng)濟性狀形成的認知,,研發(fā)相應的育種和栽培調(diào)控技術(shù),還能為其他近緣物種的相關(guān)研究提供重要的參考,。

省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級巡視員梁友強講話

  省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級巡視員梁友強表示,,省委、省政府高度重視荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展,于去年初制定廣東荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展三年行動計劃,,以荔枝產(chǎn)業(yè)“小切口”推動農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)“大變化”,。他希望華南農(nóng)大和相關(guān)科研單位加強聯(lián)合攻關(guān),爭取多出成果,、快出成果,、出大成果,為我省農(nóng)業(yè)農(nóng)村高質(zhì)量發(fā)展提供強大的科技支撐,。

省科技廳副廳長李旭東講話

  省科技廳副廳長李旭東表示,,將根據(jù)省委、省政府的部署,,繼續(xù)支持種業(yè)振興科研工作,,特別是聚焦種業(yè)振興中的“強優(yōu)勢、補短板,、破卡點”等科研問題開展攻關(guān),。他希望華南農(nóng)大以這次荔枝科研重大突破為契機,,充分發(fā)揮平臺、人才等優(yōu)勢,,為種業(yè)振興,、農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化工作提供華農(nóng)智慧。

李建國研究員介紹荔枝基因組論文主要成果

  發(fā)布會上,,李建國研究員介紹了荔枝基因組論文的主要成果,。研究團隊利用最新的基因組測序數(shù)據(jù),通過優(yōu)化基因組組裝策略,,完成‘妃子笑’荔枝基因組假染色體水平的組裝,,主要含15條假染色體序列,大小470 Mb,,雜合度2.27%,,組裝完整度BUSCO評估96.2%;同時完成基因組編碼基因的結(jié)構(gòu)注釋,,得到31,896個結(jié)構(gòu)基因,,注釋完整度BUSCO評估94.8%,是目前無患子科植物中組裝質(zhì)量最高的基因組,。
  項目組利用72份荔枝資源重測序數(shù)據(jù),,鑒定到3.88M高質(zhì)量的SNPs位點,,提出了荔枝“一個起源中心,、兩個獨立馴化事件”假說:云南是野生荔枝的起源中心,它沿著西江傳播,,在海南形成野生荔枝種群的一個主要棲息地,;此后,云南和海南野生荔枝分別獨立馴化為特早熟和晚熟品種,,特早熟品種和晚熟品種再進一步雜交形成早熟與中熟品種,。

COL基因之間的DNA片段缺失

  此外,該論文從基因組層面對荔枝開花調(diào)控機制進行了系統(tǒng)性研究,,發(fā)現(xiàn)荔枝中一段特定的DNA序列缺失,,可能是導致荔枝不同花期形成的重要因素。這一段DNA片段缺失出現(xiàn)在一對CONSTANS-like (COL)基因之間,,它可能通過調(diào)控這兩個COL基因的表達,,從而影響荔枝開花時間。這個DNA序列缺失可以開發(fā)為簡便的分子標記,,用于不同開花期荔枝品種的選育,。這對荔枝針對花期和成熟期性狀的選育種工作非常有價值,因為荔枝易腐爛,、難貯存,,選育更多極早或特晚開花的荔枝新品種對延長荔枝上市季節(jié),、減少市場季節(jié)性銷售壓力、提升荔枝種植效益非常重要,。

胡桂兵教授介紹我校荔枝科研團隊及科技攻關(guān)進展

  胡桂兵教授介紹了我校荔枝科研團隊及科技攻關(guān)進展,。1982年,華南農(nóng)學院和廣東省農(nóng)業(yè)廳牽頭成立了“廣東省荔枝科技協(xié)作組”,,時任華南農(nóng)學院副院長的李沛文教授擔任組長,;2008年,荔枝納入50個國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系之一,,陳厚彬研究員當選為國家荔枝產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學家,,體系18個崗位科學家中有9位來自我校;現(xiàn)在,,我校荔枝科技創(chuàng)新團隊是一支創(chuàng)新能力強,、國際影響力大、年齡結(jié)構(gòu)合理的研發(fā)隊伍,,2019年被評為“神農(nóng)中華科技獎優(yōu)秀創(chuàng)新團隊”,。

華南農(nóng)業(yè)大學荔枝團隊主要成員合影

  經(jīng)過老中青三代人近四十年的接力攻關(guān),團隊育成了冰荔,、觀音綠,、嶺豐糯、井崗紅糯,、巨美人等新品種19個,;植物學和園藝學頂級期刊發(fā)表高水平論文300多篇;出版《荔枝學》等專著11本,;授權(quán)發(fā)明專利15件,;獲得省部級以上獎勵16項,其中國家科技進步二等獎2項,;建立了省部級以上科技平臺7個,。
  “我們目前正與國內(nèi)外多個研究團隊合作,旨在以荔枝基因組研究為基礎(chǔ),,對更多原產(chǎn)于我國的具有重要經(jīng)濟性狀的無患子科作物開展基因組方面的研究,,如龍眼、紅毛丹,、無患子(皂莢),、倒地鈴等,通過更廣泛和更全面的比較基因組對比分析,,對無患子科作物共性或特異性生物學問題進行探索性研究,,主要研究方向包括成花誘導、特殊風味和香味形成的次生代謝產(chǎn)物、花果發(fā)育調(diào)控機制等,?!?span style="font-size:18px;font-family:宋體, simsun;line-height:1.75em;">夏瑞補充道。

  光明日報,、中國教育報,、科技日報、中國科學報,、廣東廣播電視臺,、廣州廣播電視臺、南方日報,、廣州日報,、羊城晚報、南方都市報,、信息時報,、新快報、廣東科技報,、南方農(nóng)村報,、廣州電臺等媒體對發(fā)布會進行了采訪報道。(文/陳芃辰 園藝學院 圖/費思迎 曾子焉 園藝學院)

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