論文截圖
北京時間2022年1月4日，由我校亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室牽頭，聯(lián)合相關(guān)單位完成的論文《高雜合荔枝基因組中兩個不同單倍型表明早晚熟栽培品種各自獨(dú)立馴化》（Two divergent haplotypes from a highly heterozygous lychee genome suggest independent domestication events for early and late-maturing cultivars）發(fā)表在《自然—遺傳學(xué)》（Nature Genetics）。通訊作者包括我校園藝學(xué)院李建國研究員、夏瑞教授和陳厚彬研究員，美國伊利諾伊大學(xué)香檳分校Ray Ming教授，紐約州立大學(xué)布法羅分校Victor Albert博士。第一作者為我校胡桂兵教授、馮筠庭博士生、劉成明教授、吳振先教授，廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院向旭研究員，新加坡南洋理工大學(xué)Jarkko Saloj?rvi博士和中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院王家保研究員。
荔枝基因密碼的破譯將為未來荔枝功能基因組研究提供重要的參考，對促進(jìn)荔枝品種改良和產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要意義。1月4日上午，我校在紅滿堂召開相關(guān)成果發(fā)布會。副校長仇榮亮主持發(fā)布會。
成果發(fā)布會現(xiàn)場
劉雅紅校長致辭
校長劉雅紅在致辭中介紹了我校“十三五”期間的科研進(jìn)展和果樹學(xué)科的發(fā)展情況。她指出，我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)以重大研究成果為支撐，以區(qū)域特色品種為主導(dǎo)，以打造具有華農(nóng)特色的品牌為核心，以現(xiàn)代企業(yè)管理為標(biāo)準(zhǔn)，促進(jìn)產(chǎn)前、產(chǎn)中、產(chǎn)后緊密結(jié)合，積極探索產(chǎn)學(xué)研相結(jié)合的創(chuàng)新工作模式。她希望團(tuán)隊(duì)繼續(xù)拓展研究的廣度和深度，為荔枝產(chǎn)業(yè)現(xiàn)代化插上科技的翅膀，為擦亮廣東荔枝“金字招牌”、實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)興旺和鄉(xiāng)村振興作出更大的貢獻(xiàn)。
劉耀光院士講話
“基因組是植物性狀形成的設(shè)計(jì)圖和導(dǎo)航圖，荔枝的基礎(chǔ)和應(yīng)用研究一直是亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的重要研究方向之一。”國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任劉耀光院士表示，解碼荔枝基因組不僅能提升對荔枝重要經(jīng)濟(jì)性狀形成的認(rèn)知，研發(fā)相應(yīng)的育種和栽培調(diào)控技術(shù)，還能為其他近緣物種的相關(guān)研究提供重要的參考。
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級巡視員梁友強(qiáng)講話
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級巡視員梁友強(qiáng)表示，省委、省政府高度重視荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展,于去年初制定廣東荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展三年行動計(jì)劃，以荔枝產(chǎn)業(yè)“小切口”推動農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)“大變化”。他希望華南農(nóng)大和相關(guān)科研單位加強(qiáng)聯(lián)合攻關(guān)，爭取多出成果、快出成果、出大成果，為我省農(nóng)業(yè)農(nóng)村高質(zhì)量發(fā)展提供強(qiáng)大的科技支撐。
省科技廳副廳長李旭東講話
省科技廳副廳長李旭東表示，將根據(jù)省委、省政府的部署，繼續(xù)支持種業(yè)振興科研工作，特別是聚焦種業(yè)振興中的“強(qiáng)優(yōu)勢、補(bǔ)短板、破卡點(diǎn)”等科研問題開展攻關(guān)。他希望華南農(nóng)大以這次荔枝科研重大突破為契機(jī)，充分發(fā)揮平臺、人才等優(yōu)勢，為種業(yè)振興、農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化工作提供華農(nóng)智慧。
李建國研究員介紹荔枝基因組論文主要成果
發(fā)布會上，李建國研究員介紹了荔枝基因組論文的主要成果。研究團(tuán)隊(duì)利用最新的基因組測序數(shù)據(jù)，通過優(yōu)化基因組組裝策略，完成‘妃子笑’荔枝基因組假染色體水平的組裝，主要含15條假染色體序列，大小470 Mb，雜合度2.27%，組裝完整度BUSCO評估96.2%；同時完成基因組編碼基因的結(jié)構(gòu)注釋，得到31,896個結(jié)構(gòu)基因，注釋完整度BUSCO評估94.8%，是目前無患子科植物中組裝質(zhì)量最高的基因組。
項(xiàng)目組利用72份荔枝資源重測序數(shù)據(jù)，鑒定到3.88M高質(zhì)量的SNPs位點(diǎn)，提出了荔枝“一個起源中心、兩個獨(dú)立馴化事件”假說：云南是野生荔枝的起源中心，它沿著西江傳播，在海南形成野生荔枝種群的一個主要棲息地；此后，云南和海南野生荔枝分別獨(dú)立馴化為特早熟和晚熟品種，特早熟品種和晚熟品種再進(jìn)一步雜交形成早熟與中熟品種。
COL基因之間的DNA片段缺失
此外，該論文從基因組層面對荔枝開花調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了系統(tǒng)性研究，發(fā)現(xiàn)荔枝中一段特定的DNA序列缺失，可能是導(dǎo)致荔枝不同花期形成的重要因素。這一段DNA片段缺失出現(xiàn)在一對CONSTANS-like (COL)基因之間，它可能通過調(diào)控這兩個COL基因的表達(dá)，從而影響荔枝開花時間。這個DNA序列缺失可以開發(fā)為簡便的分子標(biāo)記，用于不同開花期荔枝品種的選育。這對荔枝針對花期和成熟期性狀的選育種工作非常有價值，因?yàn)槔笾σ赘癄€、難貯存，選育更多極早或特晚開花的荔枝新品種對延長荔枝上市季節(jié)、減少市場季節(jié)性銷售壓力、提升荔枝種植效益非常重要。
胡桂兵教授介紹我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)及科技攻關(guān)進(jìn)展
胡桂兵教授介紹了我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)及科技攻關(guān)進(jìn)展。1982年，華南農(nóng)學(xué)院和廣東省農(nóng)業(yè)廳牽頭成立了“廣東省荔枝科技協(xié)作組”，時任華南農(nóng)學(xué)院副院長的李沛文教授擔(dān)任組長；2008年，荔枝納入50個國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系之一，陳厚彬研究員當(dāng)選為國家荔枝產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家，體系18個崗位科學(xué)家中有9位來自我校；現(xiàn)在，我校荔枝科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)是一支創(chuàng)新能力強(qiáng)、國際影響力大、年齡結(jié)構(gòu)合理的研發(fā)隊(duì)伍，2019年被評為“神農(nóng)中華科技獎優(yōu)秀創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”。
華南農(nóng)業(yè)大學(xué)荔枝團(tuán)隊(duì)主要成員合影
經(jīng)過老中青三代人近四十年的接力攻關(guān)，團(tuán)隊(duì)育成了冰荔、觀音綠、嶺豐糯、井崗紅糯、巨美人等新品種19個；在植物學(xué)和園藝學(xué)頂級期刊發(fā)表高水平論文300多篇；出版《荔枝學(xué)》等專著11本；授權(quán)發(fā)明專利15件；獲得省部級以上獎勵16項(xiàng)，其中國家科技進(jìn)步二等獎2項(xiàng)；建立了省部級以上科技平臺7個。
“我們目前正與國內(nèi)外多個研究團(tuán)隊(duì)合作，旨在以荔枝基因組研究為基礎(chǔ)，對更多原產(chǎn)于我國的具有重要經(jīng)濟(jì)性狀的無患子科作物開展基因組方面的研究，如龍眼、紅毛丹、無患子（皂莢）、倒地鈴等，通過更廣泛和更全面的比較基因組對比分析，對無患子科作物共性或特異性生物學(xué)問題進(jìn)行探索性研究，主要研究方向包括成花誘導(dǎo)、特殊風(fēng)味和香味形成的次生代謝產(chǎn)物、花果發(fā)育調(diào)控機(jī)制等。”夏瑞補(bǔ)充道。
光明日報(bào)、中國教育報(bào)、科技日報(bào)、中國科學(xué)報(bào)、廣東廣播電視臺、廣州廣播電視臺、南方日報(bào)、廣州日報(bào)、羊城晚報(bào)、南方都市報(bào)、信息時報(bào)、新快報(bào)、廣東科技報(bào)、南方農(nóng)村報(bào)、廣州電臺等媒體對發(fā)布會進(jìn)行了采訪報(bào)道。（文/陳芃辰 園藝學(xué)院 圖/費(fèi)思迎 曾子焉 園藝學(xué)院）
