論文截圖
北京時(shí)間2022年1月4日,,由我校亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室牽頭,,聯(lián)合相關(guān)單位完成的論文《高雜合荔枝基因組中兩個(gè)不同單倍型表明早晚熟栽培品種各自獨(dú)立馴化》(Two divergent haplotypes from a highly heterozygous lychee genome suggest independent domestication events for early and late-maturing cultivars)發(fā)表在《自然—遺傳學(xué)》(Nature Genetics)。通訊作者包括我校園藝學(xué)院李建國研究員,、夏瑞教授和陳厚彬研究員,,美國伊利諾伊大學(xué)香檳分校Ray Ming教授,,紐約州立大學(xué)布法羅分校Victor Albert博士,。第一作者為我校胡桂兵教授、馮筠庭博士生,、劉成明教授,、吳振先教授,,廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院向旭研究員,,新加坡南洋理工大學(xué)Jarkko Saloj?rvi博士和中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院王家保研究員。
荔枝基因密碼的破譯將為未來荔枝功能基因組研究提供重要的參考,,對(duì)促進(jìn)荔枝品種改良和產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要意義,。1月4日上午,我校在紅滿堂召開相關(guān)成果發(fā)布會(huì),。副校長仇榮亮主持發(fā)布會(huì),。
成果發(fā)布會(huì)現(xiàn)場(chǎng)
劉雅紅校長致辭
校長劉雅紅在致辭中介紹了我校“十三五”期間的科研進(jìn)展和果樹學(xué)科的發(fā)展情況,。她指出,,我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)以重大研究成果為支撐,以區(qū)域特色品種為主導(dǎo),,以打造具有華農(nóng)特色的品牌為核心,,以現(xiàn)代企業(yè)管理為標(biāo)準(zhǔn),促進(jìn)產(chǎn)前,、產(chǎn)中,、產(chǎn)后緊密結(jié)合,積極探索產(chǎn)學(xué)研相結(jié)合的創(chuàng)新工作模式,。她希望團(tuán)隊(duì)繼續(xù)拓展研究的廣度和深度,,為荔枝產(chǎn)業(yè)現(xiàn)代化插上科技的翅膀,為擦亮廣東荔枝“金字招牌”,、實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)興旺和鄉(xiāng)村振興作出更大的貢獻(xiàn),。
劉耀光院士講話
“基因組是植物性狀形成的設(shè)計(jì)圖和導(dǎo)航圖,荔枝的基礎(chǔ)和應(yīng)用研究一直是亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的重要研究方向之一,?!眹抑攸c(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任劉耀光院士表示,解碼荔枝基因組不僅能提升對(duì)荔枝重要經(jīng)濟(jì)性狀形成的認(rèn)知,,研發(fā)相應(yīng)的育種和栽培調(diào)控技術(shù),,還能為其他近緣物種的相關(guān)研究提供重要的參考。
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級(jí)巡視員梁友強(qiáng)講話
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳二級(jí)巡視員梁友強(qiáng)表示,,省委,、省政府高度重視荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展,于去年初制定廣東荔枝產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展三年行動(dòng)計(jì)劃,以荔枝產(chǎn)業(yè)“小切口”推動(dòng)農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)“大變化”,。他希望華南農(nóng)大和相關(guān)科研單位加強(qiáng)聯(lián)合攻關(guān),,爭(zhēng)取多出成果,、快出成果、出大成果,,為我省農(nóng)業(yè)農(nóng)村高質(zhì)量發(fā)展提供強(qiáng)大的科技支撐,。
省科技廳副廳長李旭東講話
省科技廳副廳長李旭東表示,將根據(jù)省委,、省政府的部署,,繼續(xù)支持種業(yè)振興科研工作,特別是聚焦種業(yè)振興中的“強(qiáng)優(yōu)勢(shì),、補(bǔ)短板,、破卡點(diǎn)”等科研問題開展攻關(guān)。他希望華南農(nóng)大以這次荔枝科研重大突破為契機(jī),,充分發(fā)揮平臺(tái),、人才等優(yōu)勢(shì),為種業(yè)振興,、農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化工作提供華農(nóng)智慧,。
李建國研究員介紹荔枝基因組論文主要成果
發(fā)布會(huì)上,李建國研究員介紹了荔枝基因組論文的主要成果,。研究團(tuán)隊(duì)利用最新的基因組測(cè)序數(shù)據(jù),,通過優(yōu)化基因組組裝策略,完成‘妃子笑’荔枝基因組假染色體水平的組裝,,主要含15條假染色體序列,,大小470 Mb,雜合度2.27%,,組裝完整度BUSCO評(píng)估96.2%,;同時(shí)完成基因組編碼基因的結(jié)構(gòu)注釋,得到31,896個(gè)結(jié)構(gòu)基因,,注釋完整度BUSCO評(píng)估94.8%,,是目前無患子科植物中組裝質(zhì)量最高的基因組。
項(xiàng)目組利用72份荔枝資源重測(cè)序數(shù)據(jù),,鑒定到3.88M高質(zhì)量的SNPs位點(diǎn),,提出了荔枝“一個(gè)起源中心、兩個(gè)獨(dú)立馴化事件”假說:云南是野生荔枝的起源中心,,它沿著西江傳播,,在海南形成野生荔枝種群的一個(gè)主要棲息地;此后,,云南和海南野生荔枝分別獨(dú)立馴化為特早熟和晚熟品種,,特早熟品種和晚熟品種再進(jìn)一步雜交形成早熟與中熟品種。
COL基因之間的DNA片段缺失
此外,,該論文從基因組層面對(duì)荔枝開花調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了系統(tǒng)性研究,,發(fā)現(xiàn)荔枝中一段特定的DNA序列缺失,,可能是導(dǎo)致荔枝不同花期形成的重要因素。這一段DNA片段缺失出現(xiàn)在一對(duì)CONSTANS-like (COL)基因之間,,它可能通過調(diào)控這兩個(gè)COL基因的表達(dá),,從而影響荔枝開花時(shí)間。這個(gè)DNA序列缺失可以開發(fā)為簡便的分子標(biāo)記,,用于不同開花期荔枝品種的選育,。這對(duì)荔枝針對(duì)花期和成熟期性狀的選育種工作非常有價(jià)值,因?yàn)槔笾σ赘癄€,、難貯存,,選育更多極早或特晚開花的荔枝新品種對(duì)延長荔枝上市季節(jié)、減少市場(chǎng)季節(jié)性銷售壓力,、提升荔枝種植效益非常重要。
胡桂兵教授介紹我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)及科技攻關(guān)進(jìn)展
胡桂兵教授介紹了我校荔枝科研團(tuán)隊(duì)及科技攻關(guān)進(jìn)展,。1982年,,華南農(nóng)學(xué)院和廣東省農(nóng)業(yè)廳牽頭成立了“廣東省荔枝科技協(xié)作組”,時(shí)任華南農(nóng)學(xué)院副院長的李沛文教授擔(dān)任組長,;2008年,,荔枝納入50個(gè)國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系之一,陳厚彬研究員當(dāng)選為國家荔枝產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家,,體系18個(gè)崗位科學(xué)家中有9位來自我校,;現(xiàn)在,我校荔枝科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)是一支創(chuàng)新能力強(qiáng),、國際影響力大,、年齡結(jié)構(gòu)合理的研發(fā)隊(duì)伍,2019年被評(píng)為“神農(nóng)中華科技獎(jiǎng)優(yōu)秀創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”,。
華南農(nóng)業(yè)大學(xué)荔枝團(tuán)隊(duì)主要成員合影
經(jīng)過老中青三代人近四十年的接力攻關(guān),,團(tuán)隊(duì)育成了冰荔、觀音綠,、嶺豐糯,、井崗紅糯、巨美人等新品種19個(gè),;在植物學(xué)和園藝學(xué)頂級(jí)期刊發(fā)表高水平論文300多篇,;出版《荔枝學(xué)》等專著11本;授權(quán)發(fā)明專利15件,;獲得省部級(jí)以上獎(jiǎng)勵(lì)16項(xiàng),,其中國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)2項(xiàng);建立了省部級(jí)以上科技平臺(tái)7個(gè),。
“我們目前正與國內(nèi)外多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)合作,,旨在以荔枝基因組研究為基礎(chǔ),,對(duì)更多原產(chǎn)于我國的具有重要經(jīng)濟(jì)性狀的無患子科作物開展基因組方面的研究,如龍眼,、紅毛丹,、無患子(皂莢)、倒地鈴等,,通過更廣泛和更全面的比較基因組對(duì)比分析,,對(duì)無患子科作物共性或特異性生物學(xué)問題進(jìn)行探索性研究,主要研究方向包括成花誘導(dǎo),、特殊風(fēng)味和香味形成的次生代謝產(chǎn)物,、花果發(fā)育調(diào)控機(jī)制等?!?span style="font-size:18px;font-family:宋體, simsun;line-height:1.75em;">夏瑞補(bǔ)充道,。
光明日?qǐng)?bào)、中國教育報(bào),、科技日?qǐng)?bào),、中國科學(xué)報(bào)、廣東廣播電視臺(tái),、廣州廣播電視臺(tái),、南方日?qǐng)?bào)、廣州日?qǐng)?bào),、羊城晚報(bào),、南方都市報(bào)、信息時(shí)報(bào),、新快報(bào),、廣東科技報(bào)、南方農(nóng)村報(bào),、廣州電臺(tái)等媒體對(duì)發(fā)布會(huì)進(jìn)行了采訪報(bào)道,。(文/陳芃辰 園藝學(xué)院 圖/費(fèi)思迎 曾子焉 園藝學(xué)院)